Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB5AP20339 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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