Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMY2BP19961 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms