Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PTPRAP18433 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PTPRAP18433 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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PTPRAP18433 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPRAP18433 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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PTPRAP18433 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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PTPRAP18433 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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PTPRAP18433 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PTPRAP18433 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPRAP18433 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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