Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPI1P17947 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms