Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXB9P17482 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms