Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms