Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MUC1P15941 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MUC1P15941 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MUC1P15941 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MUC1P15941 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms