Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMP4P12644 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMP4P12644 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMP4P12644 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMP4P12644 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMP4P12644 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BMP4P12644 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BMP4P12644 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms