Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms