Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms