Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHGAP10645 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHGAP10645 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHGAP10645 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHGAP10645 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHGAP10645 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHGAP10645 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHGAP10645 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHGAP10645 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHGAP10645 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHGAP10645 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms