Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C8orf89P0DMQ9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C8orf89P0DMQ9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms