Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PGA3P0DJD8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms