Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACAA1P09110 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms