Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYBBP04839 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms