Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN9O95484 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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