Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATG7O95352 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATG7O95352 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATG7O95352 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATG7O95352 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATG7O95352 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms