Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG12O94817 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG12O94817 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms