Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP2O75323 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms