Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11FIP3O75154 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms