Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SELENOFO60613 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SELENOFO60613 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms