Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIAA0556O60303 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms