Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF13O43567 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF13O43567 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF13O43567 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms