Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRPF3O43395 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms