Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRTM2O43300 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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