Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRXO43186 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRXO43186 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CRXO43186 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms