Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR3AO14802 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3AO14802 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms