Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3C2AO00443 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms