Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms