Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHMG1C9JSJ3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHMG1C9JSJ3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms