Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms