Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
C9orf92A6NGG3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms