Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L4A6NCW7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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