Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
XIRP2A4UGR9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XIRP2A4UGR9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XIRP2A4UGR9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XIRP2A4UGR9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XIRP2A4UGR9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XIRP2A4UGR9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XIRP2A4UGR9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
XIRP2A4UGR9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
XIRP2A4UGR9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
XIRP2A4UGR9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms