Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARP3Q9Y6F1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms