Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUBP2Q9Y5Y2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms