Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms