Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHKBQ9Y259 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHKBQ9Y259 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms