Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HPSEQ9Y251 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPSEQ9Y251 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPSEQ9Y251 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPSEQ9Y251 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPSEQ9Y251 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPSEQ9Y251 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPSEQ9Y251 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPSEQ9Y251 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPSEQ9Y251 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms