Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVW-1Q9UQF0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms