Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS5Q9UPZ3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms