Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF8Q9UPP1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms