Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms