Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms