Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms