Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms