Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT7Q9UIV1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms