Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms