Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP68Q9UHB9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms