Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS7AQ9UBW8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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